MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 72785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	GAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
2	NC_013790	GAGT	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	288559259
3	NC_013790	A	6	6	61	66	100 %	0 %	0 %	0 %	288559259
4	NC_013790	ATC	2	6	74	79	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559259
5	NC_013790	T	6	6	81	86	0 %	100 %	0 %	0 %	288559259
6	NC_013790	AGAA	2	8	106	113	75 %	0 %	25 %	0 %	288559259
7	NC_013790	CTG	3	9	209	217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
8	NC_013790	AGC	2	6	233	238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559259
9	NC_013790	AT	3	6	282	287	50 %	50 %	0 %	0 %	288559259
10	NC_013790	TGGA	2	8	366	373	25 %	25 %	50 %	0 %	288559259
11	NC_013790	AAG	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
12	NC_013790	TTC	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559259
13	NC_013790	ATA	2	6	521	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559259
14	NC_013790	AGC	2	6	589	594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559259
15	NC_013790	ATG	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559259
16	NC_013790	GAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
17	NC_013790	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
18	NC_013790	GCT	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
19	NC_013790	GAA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
20	NC_013790	GAA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
21	NC_013790	TAA	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559259
22	NC_013790	TTA	3	9	875	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559259
23	NC_013790	CCAAC	2	10	889	898	40 %	0 %	0 %	60 %	288559259
24	NC_013790	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
25	NC_013790	ATT	2	6	1105	1110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559259
26	NC_013790	CTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
27	NC_013790	TAGA	2	8	1165	1172	50 %	25 %	25 %	0 %	288559259
28	NC_013790	T	9	9	1205	1213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013790	T	6	6	1225	1230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013790	T	9	9	1232	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013790	ATT	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013790	T	6	6	1246	1251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013790	TTA	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013790	T	8	8	1271	1278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013790	GAT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013790	T	7	7	1293	1299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013790	T	6	6	1301	1306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013790	TG	3	6	1315	1320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013790	TTCTT	2	10	1335	1344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013790	T	7	7	1343	1349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013790	T	11	11	1351	1361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013790	T	6	6	1373	1378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013790	TTTTTC	2	12	1391	1402	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013790	T	6	6	1403	1408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013790	CAT	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013790	TAAA	2	8	1453	1460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013790	TAA	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013790	A	6	6	1477	1482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013790	AT	3	6	1488	1493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013790	AAT	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013790	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013790	AT	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013790	T	6	6	1567	1572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013790	ATTA	2	8	1586	1593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013790	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013790	GTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559260
57	NC_013790	AGG	2	6	1820	1825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559260
58	NC_013790	AAT	2	6	1850	1855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559260
59	NC_013790	ATTGA	2	10	1977	1986	40 %	40 %	20 %	0 %	288559260
60	NC_013790	GTT	2	6	1995	2000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559260
61	NC_013790	CAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559260
62	NC_013790	TG	3	6	2143	2148	0 %	50 %	50 %	0 %	288559260
63	NC_013790	TGT	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559260
64	NC_013790	TTA	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559260
65	NC_013790	AGAA	2	8	2381	2388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013790	AAT	2	6	2411	2416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013790	ATTT	2	8	2424	2431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013790	GAT	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013790	TTA	3	9	2438	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013790	TAGT	2	8	2456	2463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013790	AAAG	2	8	2515	2522	75 %	0 %	25 %	0 %	288559261
72	NC_013790	GTATTT	2	12	2589	2600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	288559261
73	NC_013790	GACT	2	8	2605	2612	25 %	25 %	25 %	25 %	288559261
74	NC_013790	GGAT	2	8	2676	2683	25 %	25 %	50 %	0 %	288559261
75	NC_013790	TTG	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
76	NC_013790	CTTG	2	8	2726	2733	0 %	50 %	25 %	25 %	288559261
77	NC_013790	GA	3	6	2751	2756	50 %	0 %	50 %	0 %	288559261
78	NC_013790	GTTG	2	8	2759	2766	0 %	50 %	50 %	0 %	288559261
79	NC_013790	TTG	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
80	NC_013790	ACA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559261
81	NC_013790	AGA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
82	NC_013790	TCT	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559261
83	NC_013790	AATCA	2	10	3205	3214	60 %	20 %	0 %	20 %	288559261
84	NC_013790	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559261
85	NC_013790	ATC	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559261
86	NC_013790	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
87	NC_013790	GTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
88	NC_013790	TAT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
89	NC_013790	GA	3	6	3543	3548	50 %	0 %	50 %	0 %	288559261
90	NC_013790	ATA	2	6	3639	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
91	NC_013790	AAGCCT	2	12	3645	3656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288559261
92	NC_013790	TGAT	2	8	3892	3899	25 %	50 %	25 %	0 %	288559261
93	NC_013790	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
94	NC_013790	TCC	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559261
95	NC_013790	AGAT	2	8	4063	4070	50 %	25 %	25 %	0 %	288559261
96	NC_013790	A	6	6	4076	4081	100 %	0 %	0 %	0 %	288559261
97	NC_013790	TTTCAA	2	12	4087	4098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288559261
98	NC_013790	AGA	2	6	4099	4104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
99	NC_013790	ATTC	2	8	4194	4201	25 %	50 %	0 %	25 %	288559261
100	NC_013790	CAA	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559261
101	NC_013790	ATG	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
102	NC_013790	AGA	2	6	4337	4342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
103	NC_013790	ATG	2	6	4380	4385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
104	NC_013790	ATA	2	6	4386	4391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
105	NC_013790	TGT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
106	NC_013790	TCT	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559261
107	NC_013790	GCTA	2	8	4529	4536	25 %	25 %	25 %	25 %	288559261
108	NC_013790	TAT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
109	NC_013790	TTTTA	2	10	4565	4574	20 %	80 %	0 %	0 %	288559261
110	NC_013790	TTA	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
111	NC_013790	TTG	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
112	NC_013790	AGT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
113	NC_013790	AT	3	6	4795	4800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013790	T	6	6	4822	4827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013790	T	7	7	4838	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013790	T	6	6	4853	4858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013790	AATT	2	8	4859	4866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013790	AT	3	6	4897	4902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013790	AT	3	6	4919	4924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013790	ACA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013790	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013790	TTAAT	2	10	4981	4990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013790	TAA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013790	T	6	6	5009	5014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013790	TTAA	2	8	5017	5024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013790	ATT	2	6	5038	5043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013790	TGA	3	9	5071	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013790	A	9	9	5179	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013790	T	6	6	5248	5253	0 %	100 %	0 %	0 %	288559262
130	NC_013790	TCG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559262
131	NC_013790	ACTTTA	2	12	5336	5347	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288559262
132	NC_013790	CTGC	2	8	5426	5433	0 %	25 %	25 %	50 %	288559262
133	NC_013790	TAGC	2	8	5483	5490	25 %	25 %	25 %	25 %	288559262
134	NC_013790	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	288559262
135	NC_013790	T	6	6	5559	5564	0 %	100 %	0 %	0 %	288559262
136	NC_013790	TCA	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
137	NC_013790	TGT	2	6	5655	5660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559262
138	NC_013790	TAC	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
139	NC_013790	TGA	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559262
140	NC_013790	TCT	2	6	5822	5827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
141	NC_013790	TTAA	2	8	5840	5847	50 %	50 %	0 %	0 %	288559262
142	NC_013790	ATC	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
143	NC_013790	TCC	2	6	5971	5976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
144	NC_013790	GAG	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559262
145	NC_013790	GAG	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559262
146	NC_013790	GTCA	2	8	6211	6218	25 %	25 %	25 %	25 %	288559262
147	NC_013790	AT	3	6	6315	6320	50 %	50 %	0 %	0 %	288559262
148	NC_013790	TCT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
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151	NC_013790	TGTT	2	8	6486	6493	0 %	75 %	25 %	0 %	288559262
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173	NC_013790	ATT	2	6	7485	7490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013790	TA	4	8	7498	7505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013790	ATT	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013790	T	7	7	7529	7535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013790	TAT	2	6	7550	7555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_013790	T	8	8	7632	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013790	T	8	8	7678	7685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013790	T	7	7	7724	7730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013790	CAT	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559263
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